1.一方面棉花采收時不分品種混采混收，棉農在籽棉交售環節存在等級混交現象。加工企業在加工過程中不分品種混軋，造成棉花品質不穩定、不均勻及雜質、籽屑含量偏多。

2.機械采收是實現棉花生產向全程機械化和精準農業的重要舉措，隨著機械采收面積的不斷擴大，對原棉品質有一定的影響，手摘與機采原棉的長度、比強度、馬克隆值均有下降趨勢，手摘與機采比較，機采長度較手摘下降0.4-0.45毫米，比強度下降0.82-1.53cn.Tex，馬克隆值下降0.1。

3.脫葉劑對長度的影響：為保證適時機采，必須在9月上旬使用脫葉劑，生育期過長的品種使用脫葉劑后，造成頂部棉鈴棉纖維不能正常自然成熟。據近年來對棉花上部鈴皮棉纖維長度的分析，未進行化學脫葉的纖維長度28.73毫米，進行化學脫葉的纖維長度28.09毫米，纖維長度減少0.64毫米，對棉花的纖維品質造成一定影響。

4.機采棉清理加工對棉纖維的損傷，機采棉一般含雜率8-16%，含水率9-16%。機采棉在清理加工時，當籽棉含水率大于9%時，雜質和棉纖維的附著力會隨著水分的增加而加大，使之很難被清除，軋出的皮棉含雜量也隨之增加。當籽棉含水率小于6%時，雖提高清雜效果，但棉纖維抗拉強度也會隨之降低。清理加工最佳籽棉含水率6.5-8%，加工出來的皮棉質量最好，機械對棉纖維長度損傷最小。