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近年來，新疆巴州纖檢所發揮技術優勢，致力于為當地棉花產業實現提質增效，幫助巴州棉花實現產業優勢的轉變，連續多年棉花公證檢驗量位居全國第一。截至目前，該所公檢數量達到44.5萬噸，檢驗8320批次，中纖局抽檢反饋的6項指標均高于全國實驗室平均水平，檢驗質量始終處于全國前列。
2004年，巴州纖檢所率先進行了棉花質量體制改革，試點時只有一家企業參與公檢，公檢量0.35噸;到2015年，已有112家141條生產線參加入庫檢驗，達到了全覆蓋。公檢實驗室面積4274平方米，辦公區和其他檢驗綜合樓面積5256平方米，共計10559平方米。項目總投資3500萬元，能夠滿足全州60萬噸棉花檢驗任務。同時每年可為社會提供200人以上的就業崗位，為巴州經濟建設可持續發展起到積極作用。
巴州是中國優質棉花重要產區之一和重要的天然纖維原料產地，有著良好的紡織工業基礎，具有發展紡織服裝產業的獨特優勢。全國第四次對口援疆工作會議提出，將新疆建成國家紡織和服裝產業重要的基地，庫爾勒建設1000萬錠紡織服裝城已列入自治區紡織服裝產業“三城七園一中心”規劃。面對如此巨大的機遇，巴州質監局以巴州纖檢所為基礎，積極籌建新疆紡織品服裝(化纖)質檢中心。2015年12月，巴州纖檢所委托東華大學開展的新疆紡織品服裝(化纖)質檢中心建設規劃及可行性方案項目經過雙方半年的努力，在上海已通過了專家論證，為新疆紡織服裝產業的發展起到積極的服務和支撐作用。
2015年底，巴州纖檢所榮獲中國合格評定國家認可委員會實驗室認可證書，這標志著該所實驗室綜合檢驗檢測能力達到了國內一流、國際先進水平，成為新疆纖檢機構中率先通過國家實驗室認可的實驗室，不僅有效地提高了實驗室管理水平和檢驗檢測能力，也極大地提升了該所的形象和實力。
一直以來，巴州纖檢所十分注視人才隊伍建設。目前，該所擁有棉花注冊質量檢驗師30人，占崗位人數的78%，高級工程師1名，高級工程師4人，占在崗人數的22%，工程師12人，占在崗人數的52%，高級工3人，占在崗人數的13%，還有纖檢專家級技術人員1名，棉檢師培訓師資人員1名，列入巴州質量專家庫成員2名，是全疆技術力量最雄厚的纖維檢驗所。
自2014年，國家在新疆率先啟動棉花目標價格改革試點工作，兩年來改革試點工作基本完成，這驗證了巴州纖檢所有能力承擔改革的重任，同時，這也要求巴州纖檢部門要利用自治區棉花目標價格改革信息平臺，形成大數據分析報告，為巴州政府和有關部門宏觀決策提供基礎數據，指導巴州地區棉農種植高產、優質的棉花，在源頭提高棉花品質、內在質量。
隨著紡織服裝產業的快速發展，巴州地區現有棉紗質量檢測技術手段滯后、人員機構力量薄弱的問題更加凸顯，已不能適應棉紡服裝產業發展以及棉紡服裝品牌化、質量化建設的需要，強化現有檢測組織機構、增強質檢檢測能力已刻不容緩。巴州纖檢所已提早謀劃積極為打造1000萬錠紡織服裝城項目做好技術支撐服務，同時盡快建立省級紡織品服裝檢驗檢測中心，以便更好地服務于巴州經濟社會發展。巴州纖檢所棉花公檢數量突破40余萬噸
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